Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 CHRNA7-203ENST00000454250 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PPARGP37231 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
PPARGP37231 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARGP37231 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARGP37231 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARGP37231 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARGP37231 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 KRT18P55-201ENST00000577198 1950 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TBL1Y-202ENST00000355162 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TAF4-201ENST00000252996 4628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 MFF-203ENST00000349901 1716 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 NES-201ENST00000368223 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PPARGP37231 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PPARGP37231 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 ZDHHC7-203ENST00000564466 1488 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PPARGP37231 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms