Protein–RNA interactions for Protein: P36383

GJC1, Gap junction gamma-1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJC1P36383 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC1P36383 HES3-201ENST00000377898 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC1P36383 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC1P36383 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
GJC1P36383 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 DMRT2-203ENST00000358146 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 CBWD3-202ENST00000377342 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
GJC1P36383 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 SGTA-201ENST00000221566 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
GJC1P36383 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 AC142381.2-201ENST00000566120 298 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MCRIP1-204ENST00000570507 765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MCRIP1-208ENST00000575061 618 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 CCDC88B-203ENST00000359902 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 RCN2-202ENST00000394883 1366 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
GJC1P36383 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 AL390816.2-201ENST00000554252 737 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
GJC1P36383 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJC1P36383 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJC1P36383 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
GJC1P36383 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
GJC1P36383 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 ADRM1-204ENST00000491935 1530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 RASEF-202ENST00000376447 5576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
GJC1P36383 PRR7-201ENST00000323249 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms