Protein–RNA interactions for Protein: P35908

KRT2, Keratin, type II cytoskeletal 2 epidermal, humanhuman

Predictions only

Length 639 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT2P35908 ZPBP-201ENST00000046087 1213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 ZSWIM7-205ENST00000472495 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
KRT2P35908 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 CHST8-202ENST00000434302 2225 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 C19orf12-205ENST00000392278 895 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
KRT2P35908 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 RGS20-202ENST00000297313 2104 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 POLR2J3-220ENST00000613744 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
KRT2P35908 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 RAMP1-203ENST00000404910 857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TRAPPC2L-213ENST00000567895 854 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
KRT2P35908 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
KRT2P35908 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 CHN1-203ENST00000409156 1761 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
KRT2P35908 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
KRT2P35908 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms