Protein–RNA interactions for Protein: P32969

RPL9, 60S ribosomal protein L9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 192 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL9P32969 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CD58-201ENST00000369487 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CD58-202ENST00000369489 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ETHE1-205ENST00000600651 1052 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
RPL9P32969 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
RPL9P32969 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 DISC1-205ENST00000366636 2224 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 FGFRL1-203ENST00000504138 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
RPL9P32969 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CD8B-205ENST00000393761 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CD8B-206ENST00000431506 692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC245052.3-201ENST00000450182 901 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ZNF148-203ENST00000468369 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 DTNBP1-201ENST00000338950 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 ZBTB42-202ENST00000555360 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
RPL9P32969 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 MAGI2-AS3-209ENST00000448195 774 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC025754.1-201ENST00000507566 407 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
RPL9P32969 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL9P32969 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.19
RPL9P32969 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 SBK2-201ENST00000344158 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 SBK2-202ENST00000413299 1085 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 PAQR4-205ENST00000576565 842 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 CIRBP-214ENST00000587896 1081 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
RPL9P32969 PGRMC2-201ENST00000296425 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 NEK6-214ENST00000545174 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
RPL9P32969 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.5 ms