Protein–RNA interactions for Protein: P32926

DSG3, Desmoglein-3, humanhuman

Predictions only

Length 999 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG3P32926 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 MFSD6L-201ENST00000329805 2188 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DSG3P32926 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 MAD2L2-204ENST00000376667 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
DSG3P32926 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 AC026471.6-201ENST00000622954 1905 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DSG3P32926 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 C16orf74-201ENST00000284245 906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 IL15RA-206ENST00000397248 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DSG3P32926 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DSG3P32926 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DSG3P32926 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AC009948.4-201ENST00000604692 675 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ITM2C-210ENST00000620962 501 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 EPHX3-202ENST00000435261 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DSG3P32926 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
DSG3P32926 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DSG3P32926 IRAK3-203ENST00000545837 1579 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms