Protein–RNA interactions for Protein: P32320

CDA, Cytidine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDAP32320 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 RITA1-201ENST00000548278 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 RBKS-201ENST00000302188 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
CDAP32320 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
CDAP32320 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 JPT1-206ENST00000476258 2289 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 SEPT5-209ENST00000438754 2241 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 ALX3-201ENST00000369792 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 ASAP2-202ENST00000315273 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
CDAP32320 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 NAPEPLD-208ENST00000427257 1822 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
CDAP32320 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
CDAP32320 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
CDAP32320 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
CDAP32320 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.9 ms