Protein–RNA interactions for Protein: P32302

CXCR5, C-X-C chemokine receptor type 5, humanhuman

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCR5P32302 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PAQR9-201ENST00000340634 2452 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PRKCD-202ENST00000394729 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 BRD9-202ENST00000467963 2156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 NXN-201ENST00000336868 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 PCSK6-214ENST00000611716 4409 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SP3-208ENST00000640958 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
CXCR5P32302 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TBL1Y-201ENST00000346432 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SLC26A5-209ENST00000393735 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RASGRP1-201ENST00000310803 5023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RASGRP1-204ENST00000539159 5021 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 C7orf43-201ENST00000316937 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RXFP3-201ENST00000330120 1852 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 RAB3A-201ENST00000222256 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CXCR5P32302 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms