Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC073111.5-204ENST00000498682 1167 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 PTP4A3-203ENST00000520105 1866 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 MRFAP1-201ENST00000320912 2049 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 LHPP-202ENST00000368842 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 HS3ST4-201ENST00000331351 3203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 LRP5L-203ENST00000444995 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 RIMBP3-201ENST00000619918 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 IGFBP6-201ENST00000301464 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 TRABD2A-201ENST00000335459 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CASQ1P31415 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 FAM66C-205ENST00000456135 1216 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TK2-216ENST00000564917 1156 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 EYA2-210ENST00000611592 2612 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ISLR2-204ENST00000453268 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 MCC-208ENST00000514701 2855 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 IL17RC-202ENST00000383812 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
CASQ1P31415 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
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