Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 SEPT7P2-202ENST00000398921 823 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PMP2-202ENST00000519260 1264 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC007216.2-201ENST00000562802 384 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 MARS-234ENST00000630571 216 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 MARS-235ENST00000630803 183 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 IL12A-201ENST00000305579 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 TCF3-203ENST00000395423 2779 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 ACP1-203ENST00000405233 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 BCAS2P3-201ENST00000416374 767 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 CCDC12-202ENST00000425441 1097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PRDM2-213ENST00000503842 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AP003170.4-201ENST00000543486 586 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 EEF1D-225ENST00000529272 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
HOXD11P31277 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 TMEM126A-201ENST00000304511 739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 IL12A-AS1-201ENST00000462431 988 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MTND5P31-201ENST00000419366 1374 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 SHISA4-201ENST00000362011 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PMAIP1-201ENST00000269518 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ZNF92P1Y-201ENST00000415010 1191 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 GPX1-202ENST00000419783 1146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ANAPC10-202ENST00000451299 928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RNU6-775P-201ENST00000459318 96 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 FAM228B-205ENST00000611127 975 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC022919.1-201ENST00000624979 626 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 GSTM3-202ENST00000361066 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CCL11-201ENST00000305869 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 AC084824.3-201ENST00000620472 856 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 LINC00570-201ENST00000417473 1330 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 NOP10-201ENST00000328848 554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
HOXD11P31277 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
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