Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 LAYN-201ENST00000375614 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 BICDL2-201ENST00000389347 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 BACE2-201ENST00000328735 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 USP21-202ENST00000368001 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ZDHHC18-202ENST00000374142 5020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 RAB1B-201ENST00000311481 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TSPOP30536 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SH2B3-201ENST00000341259 5406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TSPOP30536 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MXRA8-203ENST00000445648 2001 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ATP8A1-207ENST00000510289 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 T-202ENST00000366871 2250 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TSPOP30536 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 TOLLIP-208ENST00000527938 549 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TSPOP30536 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms