Protein–RNA interactions for Protein: P29966

MARCKS, Myristoylated alanine-rich C-kinase substrate, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 332 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCKSP29966 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 STOML2-201ENST00000356493 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 ZNF668-207ENST00000535577 2396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 FXYD7-201ENST00000270310 712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
MARCKSP29966 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
MARCKSP29966 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms