Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PSMB4P28070 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AL606970.3-201ENST00000446811 2246 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AC053503.5-201ENST00000601508 636 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 LINC00682-201ENST00000498940 1625 ntTSL 3 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 POMGNT2-202ENST00000441964 2531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PSMB4P28070 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms