Protein–RNA interactions for Protein: P25205

MCM3, DNA replication licensing factor MCM3, humanhuman

Predictions only

Length 808 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCM3P25205 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 GRM5-202ENST00000305447 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
MCM3P25205 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MFSD3-201ENST00000301327 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 USP45-205ENST00000472914 1617 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MAP3K15-201ENST00000338883 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 STX4-201ENST00000313843 1481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SOX8-201ENST00000293894 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 RBM26-202ENST00000438724 5152 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AC073314.1-201ENST00000568729 2216 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 OR7E47P-201ENST00000546390 1422 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 QKI-203ENST00000361752 9463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
MCM3P25205 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PCBP4-212ENST00000484633 2009 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SYNGR2-203ENST00000588282 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
MCM3P25205 IRX3-201ENST00000329734 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms