Protein–RNA interactions for Protein: P20810

CAST, Calpastatin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASTP20810 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASTP20810 RAB1A-202ENST00000409751 1333 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASTP20810 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASTP20810 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASTP20810 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASTP20810 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
CASTP20810 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 FAM118B-209ENST00000533050 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 AL049796.1-201ENST00000565336 1766 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
CASTP20810 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 PAQR6-213ENST00000612424 2037 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CASTP20810 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 TRIM3-202ENST00000359518 3042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CASTP20810 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CASTP20810 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 AC127029.2-201ENST00000577329 502 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CASTP20810 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CASTP20810 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms