Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 TMPO-201ENST00000261210 820 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 OAS3-207ENST00000551007 998 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 GGTLC3-201ENST00000619998 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SOX17-201ENST00000297316 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CCDC74A-201ENST00000295171 1543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CCDC74B-201ENST00000310463 1549 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 VRK2-201ENST00000340157 1888 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 LIMD2-202ENST00000578061 756 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 C16orf58-209ENST00000567994 1845 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SCRN2-212ENST00000584123 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 NFS1-201ENST00000306750 738 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 PDIA6-207ENST00000540494 2509 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ATP4AP20648 OIP5-201ENST00000220514 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 STEAP1-201ENST00000297205 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 TM4SF5-201ENST00000270560 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 CYP2T1P-201ENST00000432607 1285 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 UNC119-202ENST00000335765 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PSMD7-201ENST00000219313 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ATP4AP20648 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.1 ms