Protein–RNA interactions for Protein: P20339

RAB5A, Ras-related protein Rab-5A, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB5AP20339 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RND1-201ENST00000309739 1681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PCDHB12-202ENST00000622978 2093 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PDZD3-201ENST00000322712 2204 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ZNF37BP-201ENST00000435805 1695 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MAPKAPK3-208ENST00000621469 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 MIR210HG-201ENST00000500447 1965 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 CCDC34-201ENST00000317945 2109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 NDOR1-204ENST00000458322 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
RAB5AP20339 FRMD3-204ENST00000376438 2198 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM260-202ENST00000538838 1638 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 DALRD3-201ENST00000313778 1968 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 PAX1-202ENST00000444366 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 CTU2-202ENST00000453996 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SNX21-212ENST00000491381 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
RAB5AP20339 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms