Protein–RNA interactions for Protein: P19447

ERCC3, TFIIH basal transcription factor complex helicase XPB subunit, humanhuman

Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC3P19447 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 AC008694.1-202ENST00000636953 945 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
ERCC3P19447 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CUEDC2-201ENST00000369937 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AC069236.1-201ENST00000604339 616 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CDCA4-202ENST00000392590 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 KCNAB3-201ENST00000303790 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 ATPIF1-203ENST00000468425 539 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CIRBP-211ENST00000586773 942 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TMEM179B-205ENST00000533861 797 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AC138028.2-201ENST00000440406 1539 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AC106738.2-202ENST00000558156 533 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 GPX1-204ENST00000620890 897 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AL117328.2-201ENST00000624617 1940 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AP2S1-207ENST00000599990 829 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 MMP23B-202ENST00000378675 1309 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AVPR2-201ENST00000337474 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 UMAD1-202ENST00000463725 559 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TPT1-AS1-210ENST00000520590 873 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 CASP16P-201ENST00000428155 1433 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ERCC3P19447 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ERCC3P19447 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms