Protein–RNA interactions for Protein: P19012

KRT15, Keratin, type I cytoskeletal 15, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT15P19012 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 IRX5-202ENST00000394636 2401 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ME2-216ENST00000639850 2331 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
KRT15P19012 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 TRABD2A-203ENST00000409520 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 IL17RC-205ENST00000413608 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 WEE1-202ENST00000450114 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AP004607.7-201ENST00000527152 1677 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 TERF2IP-201ENST00000300086 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 HMBS-201ENST00000278715 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SOCS7-202ENST00000613678 1827 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SQLE-206ENST00000523430 1879 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 BLCAP-208ENST00000414542 2205 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 BASP1-203ENST00000616743 1711 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
KRT15P19012 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT15P19012 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
KRT15P19012 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 LHX6-201ENST00000340587 3457 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 RHNO1-204ENST00000489288 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
KRT15P19012 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 GABARAPL3-202ENST00000624044 1851 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 RCE1-202ENST00000524506 1379 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
KRT15P19012 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.5 ms