Protein–RNA interactions for Protein: P17481

HOXB8, Homeobox protein Hox-B8, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 243 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB8P17481 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AC243732.1-201ENST00000612648 864 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 FAHD1-201ENST00000382666 1964 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 RBM17P2-201ENST00000616397 1405 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 UNC93B5-201ENST00000530315 699 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 MAPK9-206ENST00000425491 2266 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 MIF4GD-202ENST00000325102 1306 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 TMEM175-212ENST00000508204 1399 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 DGCR6L-202ENST00000405465 962 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 PLEKHJ1-205ENST00000587394 937 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 WT1-204ENST00000448076 2114 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AL121761.1-202ENST00000412571 415 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 UNC93B4-201ENST00000505679 747 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 MMP23B-201ENST00000356026 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
HOXB8P17481 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 DNPH1-202ENST00000393987 796 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 LINC01962-201ENST00000513771 411 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
HOXB8P17481 KCNK4-201ENST00000394525 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms