Protein–RNA interactions for Protein: P16070

CD44, CD44 antigen, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 742 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD44P16070 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 ASCL2-201ENST00000331289 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 ZDHHC16-205ENST00000370846 1280 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CD44P16070 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 ZNF821-202ENST00000425432 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 UBR2-203ENST00000372903 2423 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 NIFKP4-201ENST00000567275 1192 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 FAM69B-202ENST00000371692 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 FGF7P6-201ENST00000377614 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 BX664615.2-202ENST00000639056 1888 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 RTP5-201ENST00000343216 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 WDSUB1-202ENST00000359774 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
CD44P16070 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 TPCN2-209ENST00000637504 2736 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 LINC01574-201ENST00000512115 560 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CD44P16070 IRF7-204ENST00000397570 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 NOXA1-202ENST00000392815 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 ADAM9-203ENST00000466936 2053 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 AC008443.4-201ENST00000503314 456 ntTSL 4 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 MMP17-201ENST00000360564 2411 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CD44P16070 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 ACOT2-201ENST00000238651 1774 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 AC091305.1-201ENST00000479476 895 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 FEZF1-203ENST00000442488 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CD44P16070 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 ZNF800-208ENST00000619291 2099 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CD44P16070 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 ITGB1BP1-202ENST00000355346 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 LYN-202ENST00000519728 2297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 KRT3-201ENST00000417996 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CD44P16070 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms