Protein–RNA interactions for Protein: P15085

CPA1, Carboxypeptidase A1, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA1P15085 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
CPA1P15085 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
CPA1P15085 CCDC160-201ENST00000370809 1299 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA1P15085 CCDC28B-201ENST00000373602 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA1P15085 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA1P15085 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA1P15085 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA1P15085 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
CPA1P15085 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ANTXR2-202ENST00000346652 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 LRRC3C-201ENST00000377924 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 TMEM17-201ENST00000335390 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 AL157384.1-201ENST00000445995 2473 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
CPA1P15085 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 MFF-207ENST00000409565 1548 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 UCK2-201ENST00000367879 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
CPA1P15085 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
CPA1P15085 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPA1P15085 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
CPA1P15085 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
CPA1P15085 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA1P15085 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA1P15085 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA1P15085 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
CPA1P15085 MSRB1-201ENST00000361871 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 YBX1-201ENST00000321358 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
CPA1P15085 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms