Protein–RNA interactions for Protein: P14678

SNRPB, Small nuclear ribonucleoprotein-associated proteins B and B', humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPBP14678 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 DNAAF3-201ENST00000391720 2169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CPT2-203ENST00000635862 2319 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 CHST8-203ENST00000438847 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC084116.4-201ENST00000524320 484 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 NAGK-229ENST00000613852 1801 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
SNRPBP14678 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PYCR3-207ENST00000495276 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 UGP2-201ENST00000337130 2338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PRMT5-228ENST00000627278 129 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC003102.1-202ENST00000563394 1796 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FAM53A-202ENST00000461064 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SLC16A5-201ENST00000329783 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 MAP4K4-210ENST00000425019 4403 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PDCD2-203ENST00000443345 1897 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PXYLP1-203ENST00000502783 2066 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 UBE2B-201ENST00000265339 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AKR7A2-201ENST00000235835 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 LAYN-204ENST00000525126 1763 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 ZGPAT-206ENST00000448100 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 GPR108-201ENST00000264080 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
SNRPBP14678 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.7 ms