Protein–RNA interactions for Protein: P14324

FDPS, Farnesyl pyrophosphate synthase, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FDPSP14324 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDPSP14324 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDPSP14324 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDPSP14324 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDPSP14324 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
FDPSP14324 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDPSP14324 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
FDPSP14324 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 MAFF-204ENST00000426621 2216 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
FDPSP14324 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
FDPSP14324 KRT87P-202ENST00000534226 1464 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 HSF4-215ENST00000521374 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TMEM178A-201ENST00000281961 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
FDPSP14324 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 KIAA0895-204ENST00000415803 2865 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
FDPSP14324 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 P2RX2-202ENST00000348800 1222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 P2RX2-204ENST00000351222 1140 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 P2RX2-207ENST00000449132 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 SAMD10-201ENST00000369886 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 ABLIM2-204ENST00000407564 2291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
FDPSP14324 PPCS-203ENST00000372561 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 H2AFX-202ENST00000530167 1614 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 NRL-201ENST00000396995 810 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 IRX4-206ENST00000513692 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
FDPSP14324 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 HDAC11-211ENST00000433119 2043 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 RNH1-222ENST00000533410 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 C14orf79-207ENST00000550614 1912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 SCARB2-219ENST00000639738 1517 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 CA7-201ENST00000338437 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
FDPSP14324 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDPSP14324 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDPSP14324 METTL1-202ENST00000324871 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDPSP14324 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
FDPSP14324 MAMSTR-202ENST00000356751 1825 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms