Protein–RNA interactions for Protein: P13994

CCDC130, Coiled-coil domain-containing protein 130, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC130P13994 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 NR2F2-204ENST00000453270 1712 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AC084757.3-201ENST00000558061 1943 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MFSD11-216ENST00000590393 1141 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PRICKLE3-206ENST00000599218 2062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SPINT2-202ENST00000454580 1367 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 ZNF717-203ENST00000477374 1169 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 TM7SF2-201ENST00000279263 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 HPCAL1-201ENST00000307845 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 LMAN2-201ENST00000303127 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PXK-211ENST00000484288 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SPTBN4-203ENST00000392023 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 DUSP2-201ENST00000288943 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 EDA-210ENST00000527388 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SEC23A-213ENST00000557280 561 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 P4HTM-202ENST00000383729 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 GAS2L1P2-201ENST00000436355 1356 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AC133555.3-201ENST00000549950 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 AC106782.1-201ENST00000550538 1693 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SNX7-201ENST00000306121 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 PPP1R3F-203ENST00000466508 1885 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 SPOP-206ENST00000504102 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CCDC130P13994 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.4 ms