Protein–RNA interactions for Protein: P13985

HRES1, Putative HTLV-1-related endogenous sequence, humanhuman

Predictions only

Length 223 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HRES1P13985 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.56□□□□□ -0.56
HRES1P13985 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GFRA3-201ENST00000274721 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ARSA-202ENST00000356098 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PLEKHO1-201ENST00000369124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GMDS-202ENST00000380815 1752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 BMP1-202ENST00000306385 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GCH1-206ENST00000543643 1897 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC11.55□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 FAM129C-207ENST00000599124 1918 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GOLGA2P6-201ENST00000340929 2049 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GTF3C5-202ENST00000372097 2406 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 LRRC34-201ENST00000446859 1718 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.54□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 RHBDD2-201ENST00000006777 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CRHR1-203ENST00000339069 2490 ntTSL 2 BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC11.53□□□□□ -0.56
HRES1P13985 INPP1-202ENST00000392329 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 TMEM62-201ENST00000260403 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.52□□□□□ -0.56
HRES1P13985 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.52□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.2 ms