Protein–RNA interactions for Protein: P12980

LYL1, Protein lyl-1, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LYL1P12980 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 TRA2A-201ENST00000297071 1845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
LYL1P12980 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AC007249.2-201ENST00000553181 1737 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 PEX5-204ENST00000412720 2105 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
LYL1P12980 MAP3K14-AS1-203ENST00000585780 2475 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LYL1P12980 UBTD2-201ENST00000393792 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LYL1P12980 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PLK5-205ENST00000642079 1969 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ERF-202ENST00000440177 2032 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC020907.5-201ENST00000624372 1936 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 IVD-206ENST00000487418 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 RCN3-201ENST00000270645 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 NKX2-8-201ENST00000258829 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AL162377.1-201ENST00000618844 1793 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 SNX32-201ENST00000308342 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
LYL1P12980 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 CAMKK2-208ENST00000412367 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 TIGD5-201ENST00000504548 5390 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 FAM213A-202ENST00000372185 1723 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 HTRA2-202ENST00000352222 1450 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
LYL1P12980 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 CTU2-210ENST00000567949 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 NEUROG3-201ENST00000242462 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 LINC01089-202ENST00000429892 1521 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
LYL1P12980 EI24-211ENST00000534546 1544 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22 ms