Protein–RNA interactions for Protein: P11488

GNAT1, Guanine nucleotide-binding protein G(t) subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GNAT1P11488 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 AC244517.4-202ENST00000624089 484 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 SH2D5-202ENST00000444387 1934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 SCARB1-211ENST00000546215 1597 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 DUSP18-205ENST00000404885 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 RNF180-201ENST00000296615 1727 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 NAT16-202ENST00000443096 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 CD44-222ENST00000526025 1052 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 PTGER2-202ENST00000557436 643 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 LINC02175-201ENST00000571219 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 PDK3-201ENST00000379162 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 COMMD5-207ENST00000543949 1571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 LAMP5-AS1-201ENST00000443469 1928 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 NUDT8-202ENST00000376693 728 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 RNA5SP413-201ENST00000516373 109 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 C1orf174-201ENST00000361605 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GNAT1P11488 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 IGFBP1-203ENST00000468955 1369 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 AC010980.2-201ENST00000587099 1412 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 AC097658.1-201ENST00000475555 843 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 BIN1-202ENST00000316724 2693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 GCH1-202ENST00000395514 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 MGAT4D-208ENST00000515354 1806 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GNAT1P11488 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms