Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC138649.1-201ENST00000619611 1449 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AL355102.2-201ENST00000553811 600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 DBP-201ENST00000222122 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 LINC00094-201ENST00000432807 2300 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 PRRT4-207ENST00000535159 2897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 C8orf82-201ENST00000313465 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 PPP2R5E-204ENST00000555899 2164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 PHLDB3-207ENST00000599242 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 PMPCA-203ENST00000399219 1987 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 UCHL1-201ENST00000284440 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 UCHL1-210ENST00000512788 785 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 EDA-209ENST00000525810 843 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CPT2-209ENST00000636935 803 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 HMCES-203ENST00000417226 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 AC005224.4-201ENST00000583262 1652 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 SPHK1-202ENST00000392496 1779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
ITGAMP11215 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 MAG-201ENST00000361922 2426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HHIPL1-202ENST00000357223 2241 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 A1BG-201ENST00000263100 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 DOC2A-218ENST00000616445 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TUBA1A-201ENST00000295766 1887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TUB-203ENST00000534099 1759 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SLC22A17-202ENST00000354772 2238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 FAXDC2-211ENST00000520968 558 ntTSL 4 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 OSR1-201ENST00000272223 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ATG4D-201ENST00000309469 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 APPL2-201ENST00000258530 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 KCNQ1-202ENST00000335475 2159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 PXK-203ENST00000383715 1756 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 Z98882.1-201ENST00000622160 2253 ntBASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 PWWP2A-205ENST00000523662 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 SDR39U1-208ENST00000554698 1364 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 UNC93B1-201ENST00000227471 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 CD7-207ENST00000584284 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 PRKAA1-202ENST00000354209 1918 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
ITGAMP11215 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms