Protein–RNA interactions for Protein: P10809

HSPD1, 60 kDa heat shock protein, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSPD1P10809 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 PELI3-201ENST00000320740 2740 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 PAQR6-212ENST00000540423 1729 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
HSPD1P10809 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 FEM1AP4-201ENST00000443167 1987 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 C10orf91-202ENST00000392630 1846 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 VKORC1L1-202ENST00000434382 1541 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 TMEM125-201ENST00000432792 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 RASSF1-203ENST00000359365 1923 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 TPTEP1-205ENST00000558085 1738 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
HSPD1P10809 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms