Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD1

RGPD2, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,756 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD2P0DJD1 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 SCARA5-203ENST00000518030 1074 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 PGAM5-204ENST00000543955 1773 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 WDR88-201ENST00000355868 1718 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC096537.1-201ENST00000437416 684 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
RGPD2P0DJD1 AUH-202ENST00000375731 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 NAA20-202ENST00000334982 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 INS-203ENST00000397262 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 IGFBP6-203ENST00000548547 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 RELL2-207ENST00000521367 1780 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AC092384.1-201ENST00000378347 1812 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 GRTP1-201ENST00000326039 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 ZSCAN18-212ENST00000600404 1934 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 GCC2-AS1-201ENST00000322353 558 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 SEC61A2-206ENST00000379051 707 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 PBX1-209ENST00000485769 834 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 CYP2T3P-201ENST00000601990 817 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 LHFPL3-202ENST00000424859 1852 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 TSPAN3-202ENST00000346495 1647 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 NT5C3B-203ENST00000435506 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 HSF2BP-201ENST00000291560 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 NUF2-208ENST00000524800 1845 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 CHRAC1-203ENST00000519533 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 TERF1-202ENST00000276603 1677 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 PRAF2-202ENST00000553851 1334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 PYCR1-216ENST00000619204 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
RGPD2P0DJD1 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 ABHD12B-202ENST00000353130 1477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RGPD2P0DJD1 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms