Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 UCHL5-205ENST00000367454 1815 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 AC007322.1-201ENST00000426983 750 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ALDH5A1-204ENST00000491546 1699 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 HAUS4-201ENST00000206474 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 UPF1-207ENST00000599848 5311 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NFKBIL1-203ENST00000376148 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 USP45-202ENST00000329966 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 AC009086.2-201ENST00000449759 610 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 COL19A1-203ENST00000478620 589 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 DUX4L16-201ENST00000555130 1264 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 TBC1D22A-206ENST00000407381 1949 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 GPR137-201ENST00000313074 1485 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NOX4-209ENST00000527626 1774 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 DTYMK-201ENST00000305784 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CPED1-202ENST00000340646 1056 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 RNF146-206ENST00000480444 843 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 AC018553.2-201ENST00000637770 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CROCCP5-201ENST00000436658 830 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CREB3L3-202ENST00000595923 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 RAB28-203ENST00000338176 1787 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
HBQ1P09105 ARFRP1-202ENST00000607873 1061 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms