Protein–RNA interactions for Protein: P08138

NGFR, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 16, humanhuman

Predictions only

Length 427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NGFRP08138 CPEB1-AS1-201ENST00000560650 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
NGFRP08138 PPP3CC-203ENST00000397775 2094 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SLC1A6-203ENST00000544886 2420 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 DCTD-202ENST00000438320 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC010141.2-201ENST00000452426 721 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SERP1-208ENST00000491660 830 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ODC1-201ENST00000234111 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 OLIG3-201ENST00000367734 2049 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 TNFAIP8L3-202ENST00000637513 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 MRPL37-206ENST00000605337 1582 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
NGFRP08138 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 DDIT4-201ENST00000307365 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 LARP6-202ENST00000344870 527 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC004854.2-201ENST00000608450 1441 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SLC41A3-201ENST00000315891 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SEPT5-210ENST00000455784 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 TMEM54-202ENST00000373463 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 GRINA-202ENST00000395068 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
NGFRP08138 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 DYM-203ENST00000442713 2147 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 GALNS-213ENST00000569433 723 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC104187.1-201ENST00000607510 612 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CPNE9-203ENST00000383832 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
NGFRP08138 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ZNF446-208ENST00000622313 1884 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC093833.1-201ENST00000442821 553 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 FAM3A-202ENST00000359889 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
NGFRP08138 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NGFRP08138 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NGFRP08138 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NGFRP08138 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
NGFRP08138 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NGFRP08138 RASGEF1C-201ENST00000361132 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NGFRP08138 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
NGFRP08138 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms