Protein–RNA interactions for Protein: P04921

GYPC, Glycophorin-C, humanhuman

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GYPCP04921 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 TDRD10-202ENST00000368482 2331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 PLEKHB1-204ENST00000398494 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SDHAF3-202ENST00000432641 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 TMEM80-201ENST00000397510 1094 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 GPAA1-202ENST00000361036 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 EPS8L1-201ENST00000201647 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 WDR4-202ENST00000398208 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 DUSP15-201ENST00000278979 1732 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 EGFL7-201ENST00000308874 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 CKMT1B-207ENST00000441322 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GYPCP04921 MYO1D-213ENST00000583621 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 HDGFL2-208ENST00000616600 2281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 ABHD12B-201ENST00000337334 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 TPCN2-205ENST00000542467 2000 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SMIM11B-205ENST00000624304 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 MEDAG-201ENST00000380482 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 RUSC1-AS1-203ENST00000450199 1636 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 CHRNA3-202ENST00000348639 2030 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SLC43A3-225ENST00000533524 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 DTX3-201ENST00000337737 2029 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GYPCP04921 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GYPCP04921 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GYPCP04921 CYP1B1-207ENST00000614273 2174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 EEF1D-246ENST00000532741 2387 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SLC25A22-228ENST00000628067 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 TCP11-203ENST00000373974 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SLC44A3-203ENST00000446120 2094 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 DR1-201ENST00000370267 1647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GYPCP04921 BRICD5-201ENST00000328540 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 CCNE1-201ENST00000262643 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 MON1A-201ENST00000296473 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SLC46A3-202ENST00000380814 2121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 TGFBR3L-202ENST00000565886 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 LINC01632-201ENST00000615763 496 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 EGLN2-202ENST00000406058 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GYPCP04921 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 AC027702.1-201ENST00000563810 1770 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 DEDD2-201ENST00000336034 1882 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 ANKRD11-217ENST00000613312 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SAE1-203ENST00000413379 2313 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GYPCP04921 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms