Protein–RNA interactions for Protein: P04198

MYCN, N-myc proto-oncogene protein, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYCNP04198 SERTAD3-201ENST00000322354 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 ZFP91-CNTF-201ENST00000389919 2319 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 DHRS2-202ENST00000344777 1678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 LINC01191-201ENST00000412690 844 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 HCG24-202ENST00000414398 717 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC021660.2-201ENST00000502999 388 ntTSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 FAM32A-205ENST00000589852 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 UBXN2B-206ENST00000638450 591 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 KCNH6-203ENST00000580652 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
MYCNP04198 QPCT-201ENST00000338415 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC007322.4-201ENST00000509611 723 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 ISCU-212ENST00000547005 795 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AP006587.3-201ENST00000525742 1516 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SMARCB1-202ENST00000344921 1728 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TUSC3-203ENST00000503731 1498 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 RNPS1-201ENST00000301730 1276 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SMNDC1-201ENST00000369592 1110 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 LYRM1-205ENST00000562740 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 SPNS1-203ENST00000334536 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
MYCNP04198 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCNP04198 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCNP04198 HADH-201ENST00000309522 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AL512625.2-201ENST00000417533 625 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCNP04198 GCSHP5-201ENST00000443090 522 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCNP04198 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
MYCNP04198 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYCNP04198 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
MYCNP04198 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 ASIP-201ENST00000374954 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 C22orf34-203ENST00000405854 1593 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 QTRT1-201ENST00000250237 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
MYCNP04198 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 AC007285.1-201ENST00000422239 893 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 AC105001.1-201ENST00000506149 821 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 AC068672.2-201ENST00000524022 336 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 AC011611.3-201ENST00000552367 569 ntTSL 4 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
MYCNP04198 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCNP04198 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCNP04198 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
MYCNP04198 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.4 ms