Protein–RNA interactions for Protein: P02671

FGA, Fibrinogen alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGAP02671 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
FGAP02671 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 CCDC189-206ENST00000543610 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 PTPN18-202ENST00000347849 2472 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
FGAP02671 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGAP02671 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGAP02671 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGAP02671 MANBAL-202ENST00000373606 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGAP02671 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGAP02671 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGAP02671 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
FGAP02671 CASTOR1-201ENST00000404953 1460 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 DPYS-201ENST00000351513 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 LIN7B-201ENST00000221459 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 SEC11A-208ENST00000559729 1256 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FGAP02671 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGAP02671 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGAP02671 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGAP02671 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGAP02671 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGAP02671 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FGAP02671 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 RARRES2-201ENST00000223271 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 SNAP23-214ENST00000567094 834 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 AC016888.1-201ENST00000585285 565 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 SMAGP-205ENST00000603864 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FGAP02671 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 SLC7A5P1-201ENST00000568957 537 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 DM1-AS-203ENST00000590076 730 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
FGAP02671 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 KDF1-201ENST00000320567 1793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 PARP1-202ENST00000366792 553 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 BX322557.1-202ENST00000400362 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 KRT16P2-201ENST00000414673 1423 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 PUS1-203ENST00000443358 1664 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 HAUS4-205ENST00000541587 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 LINC01901-201ENST00000585822 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 UBE2Q2P2-204ENST00000618775 648 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 MYCNOS-205ENST00000641950 531 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
FGAP02671 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 AC132008.2-203ENST00000418868 1552 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 FAM66A-201ENST00000525829 921 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
FGAP02671 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms