Protein–RNA interactions for Protein: P01574

IFNB1, Interferon beta, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFNB1P01574 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 DNAAF4-201ENST00000321149 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 IL20RA-202ENST00000367746 1244 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 Z97653.1-201ENST00000567096 446 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 TRAPPC6A-205ENST00000592647 514 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 SPRTN-201ENST00000008440 1667 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 CLN8-213ENST00000637156 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
IFNB1P01574 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 DAPK3-201ENST00000301264 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 C12orf76-203ENST00000546651 1755 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 C16orf86-201ENST00000403458 1267 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 RALB-203ENST00000420510 1252 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 UQCR11-203ENST00000591899 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 POFUT1-201ENST00000375730 1507 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CELF2-213ENST00000633077 1733 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 FAHD1-202ENST00000382668 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SLC2A11-202ENST00000316185 1555 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 NDUFB2-212ENST00000476279 1666 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PLCL1-201ENST00000428675 5125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CHTF8-208ENST00000522091 863 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CXCL16-203ENST00000574412 1668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 POMGNT2-201ENST00000344697 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MAPT-210ENST00000535772 5718 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MAF1-205ENST00000534585 1754 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SERBP1-202ENST00000370990 1621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PROSER2-205ENST00000622831 1646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 NDUFS3-206ENST00000528192 561 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 JADE2-204ENST00000402835 2797 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CEL-201ENST00000372080 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 GJC2-201ENST00000366714 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 NDUFAF3-202ENST00000326925 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 ZC3HAV1L-201ENST00000275766 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 TRMT2A-204ENST00000439169 2473 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SMPD5-201ENST00000528912 1390 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 CALM1-202ENST00000447653 1104 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 SCO2-204ENST00000543927 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
IFNB1P01574 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms