Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1RP00736 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1RP00736 GGA2-211ENST00000567468 1713 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1RP00736 ALG1-202ENST00000544428 1419 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
C1RP00736 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 CBWD6-213ENST00000613716 1820 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 TUB-201ENST00000299506 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 C16orf59-201ENST00000361837 1662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 SOX18-201ENST00000340356 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
C1RP00736 GPR6-202ENST00000414000 1945 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 CDK5-204ENST00000485972 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 TRPT1-201ENST00000317459 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 HLA-C-203ENST00000383329 1554 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 SLC25A24P1-201ENST00000411846 1569 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
C1RP00736 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 NEURL3-201ENST00000310865 1710 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 ARNTL2-209ENST00000546179 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
C1RP00736 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 CFC1-201ENST00000259216 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 CFC1B-201ENST00000281882 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 PET117-201ENST00000432901 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 TMEM176B-203ENST00000434545 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 KREMEN2-203ENST00000571007 1877 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
C1RP00736 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 GRAMD1A-201ENST00000317991 2695 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 TXNL4A-203ENST00000585474 1185 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
C1RP00736 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 YIF1B-213ENST00000591755 1077 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 CFAP99-206ENST00000616117 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 PAQR6-205ENST00000368270 1765 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
C1RP00736 AC061975.6-201ENST00000579045 1553 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
C1RP00736 SCO2-201ENST00000252785 992 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.4 ms