Protein–RNA interactions for Protein: O95926

SYF2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2O95926 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PABPC4-204ENST00000372862 2470 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYF2O95926 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYF2O95926 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYF2O95926 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
SYF2O95926 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 RGMA-210ENST00000557301 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 FUT5-202ENST00000588525 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 FLVCR1-201ENST00000366971 5939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 CNTNAP3B-212ENST00000617422 2170 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
SYF2O95926 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 DUSP26-201ENST00000256261 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 SUSD1-203ENST00000374264 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
SYF2O95926 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
SYF2O95926 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CHD1L-201ENST00000361293 2484 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CDC14A-203ENST00000370124 1883 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 NR1H2-204ENST00000593926 1828 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
SYF2O95926 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TTC12-202ENST00000393020 2541 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 OGG1-202ENST00000302008 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 PDXDC1-205ENST00000535621 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TMEM198-202ENST00000373883 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 MAP3K21-203ENST00000366624 5809 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 EPCAM-202ENST00000405271 1530 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
SYF2O95926 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SUSD1-204ENST00000374270 3124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 BAD-203ENST00000394532 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
SYF2O95926 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 GMPPA-205ENST00000373917 1630 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SLC35E4-202ENST00000406566 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SYF2O95926 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms