Protein–RNA interactions for Protein: O95630

STAMBP, STAM-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STAMBPO95630 ZNF513-202ENST00000407879 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 BRI3-201ENST00000297290 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 TNIP1-205ENST00000518977 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
STAMBPO95630 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 HGH1-201ENST00000347708 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MATR3-206ENST00000503811 2518 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PGF-201ENST00000238607 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TPST1-201ENST00000304842 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 IKBKG-212ENST00000617207 1949 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 LINC01547-202ENST00000397841 2303 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TMEM51-203ENST00000400796 1842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC074143.1-203ENST00000518227 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TAF6L-201ENST00000294168 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 OTOP1-201ENST00000296358 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 GRB10-206ENST00000402497 2289 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MATN4-204ENST00000372756 2077 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MFSD14C-208ENST00000637864 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 RNF32-207ENST00000405335 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ARHGAP11A-205ENST00000563864 2279 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TANGO2-212ENST00000434570 2180 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NDUFAF6-203ENST00000396124 1798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 FASTK-212ENST00000482571 1764 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
STAMBPO95630 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.6 ms