Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 MEIS1-AS3-201ENST00000454167 707 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 GATA6-AS1-202ENST00000583490 1788 ntTSL 2 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
TRMUO75648 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SCUBE1-201ENST00000290460 2258 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ADAMTS2-202ENST00000274609 2044 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 TOP1MT-201ENST00000329245 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ITPKB-202ENST00000366784 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 EPHX3-201ENST00000221730 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 TTBK1-202ENST00000304139 2449 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ADAP1-218ENST00000617043 1946 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
TRMUO75648 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 GATA2-AS1-201ENST00000464242 1163 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 PRPF39-201ENST00000355765 2868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 PMPCB-202ENST00000428154 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
TRMUO75648 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 FBXL14-201ENST00000339235 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ME2-206ENST00000638410 2289 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ME2-210ENST00000639255 2262 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 AL158151.1-201ENST00000372490 2047 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 RNF38-205ENST00000377877 1974 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 POTEC-204ENST00000620346 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
TRMUO75648 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 CENPB-201ENST00000379751 2840 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 RBMS1-205ENST00000409972 1815 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
TRMUO75648 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms