Protein–RNA interactions for Protein: O43602

DCX, Neuronal migration protein doublecortin, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCXO43602 GPR137-203ENST00000411458 1495 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
DCXO43602 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCXO43602 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
DCXO43602 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 FAM207A-201ENST00000291634 927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 FAM47E-204ENST00000510328 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 PLEKHB1-216ENST00000543085 632 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 MREG-201ENST00000263268 1314 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 NAA10-208ENST00000464845 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
DCXO43602 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 EFCAB6-202ENST00000356087 1129 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 LINC01301-204ENST00000530725 577 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 NDUFS3-212ENST00000534208 583 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 AC138907.5-202ENST00000569484 235 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
DCXO43602 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 ELOA3B-201ENST00000611323 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 ELOA3D-201ENST00000620881 1641 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 DNAH17-AS1-202ENST00000591373 1453 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 TPPP3-204ENST00000562206 1410 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 C4orf48-201ENST00000409248 433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 PTGIR-205ENST00000597185 775 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
DCXO43602 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 KCNA2-206ENST00000638477 1524 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 VDAC1-203ENST00000395047 1873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
DCXO43602 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 TPT1-AS1-211ENST00000520622 604 ntTSL 4 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 DHRS4L2-204ENST00000537912 918 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 PPP1R12B-202ENST00000356764 1687 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
DCXO43602 NHLH1-201ENST00000302101 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 NMRK1-201ENST00000361092 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 PRMT1-221ENST00000610806 1192 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
DCXO43602 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.3 ms