Protein–RNA interactions for Protein: O43313

ATMIN, ATM interactor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMINO43313 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 TTC39C-202ENST00000317571 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ATMINO43313 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ALG1-201ENST00000262374 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 STX5-203ENST00000394690 1568 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 RABL2B-206ENST00000395598 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FMR1-204ENST00000370471 4125 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MANEAL-202ENST00000373045 2685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PACRGL-227ENST00000513459 1773 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ATMINO43313 LRRC3B-201ENST00000396641 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FAM66D-201ENST00000434078 918 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 COCH-205ENST00000475087 1997 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 HTRA3-202ENST00000382512 2023 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FIP1L1-201ENST00000306932 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 GSG1L-202ENST00000395724 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 VPS13B-204ENST00000441350 1626 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 OIP5-AS1-202ENST00000501665 1384 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ATMINO43313 LINC01123-202ENST00000419296 2436 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 TPM1-208ENST00000404484 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ARL6IP4-220ENST00000543566 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 NUDT16L1-202ENST00000405142 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 GFI1-203ENST00000427103 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ATMINO43313 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 CEBPE-201ENST00000206513 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 DCTN3-202ENST00000341694 899 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 HBM-201ENST00000356815 506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 DCTN3-205ENST00000378916 773 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 SCN1B-203ENST00000595652 814 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ZNF622-201ENST00000308683 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 TRIM15-210ENST00000619857 2217 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AC007128.1-201ENST00000424460 1853 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ATMINO43313 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FXN-202ENST00000396364 980 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 RORB-AS1-201ENST00000417576 1178 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 NAAA-201ENST00000286733 1900 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 E4F1-206ENST00000565090 2028 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 HSD11B1L-201ENST00000301382 1457 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
ATMINO43313 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATMINO43313 ZFAND6-224ENST00000618205 1659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
ATMINO43313 UBE2I-205ENST00000402301 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 CDKN2D-201ENST00000335766 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
ATMINO43313 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.3 ms