Protein–RNA interactions for Protein: O43242

PSMD3, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD3O43242 SLC13A3-204ENST00000413164 2008 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 CSNK1G3-206ENST00000511130 1356 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PSMD3O43242 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 VPS29-206ENST00000549578 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 HAND1-201ENST00000231121 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 PPCS-202ENST00000372560 793 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 ANAPC13-204ENST00000510994 1840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PSMD3O43242 PLSCR3-201ENST00000324822 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 ARSA-205ENST00000453344 1650 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 P2RX4-202ENST00000337233 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 CENPU-201ENST00000281453 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PSMD3O43242 IKBKG-206ENST00000594239 2299 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 TEAD2-208ENST00000598810 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 MRAS-202ENST00000423968 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 ADAMTS13-204ENST00000371911 1155 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 CDKN2A-210ENST00000530628 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 NGLY1-204ENST00000396649 2024 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 LSM14A-202ENST00000540746 2152 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 SH3GL1-206ENST00000598564 2194 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PSMD3O43242 EPHA8-202ENST00000374644 1802 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 FMR1-AS1-202ENST00000596112 1845 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 WWTR1-AS1-202ENST00000479752 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 EEF1D-204ENST00000423316 2378 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 CLPSL2-201ENST00000360454 488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 AC079140.4-201ENST00000507448 529 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 SPTBN4-201ENST00000338932 8686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 TMEM129-206ENST00000536901 2172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ST8SIA2-201ENST00000268164 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ZGPAT-204ENST00000369967 1890 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 SFTPC-205ENST00000521315 1046 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 SOX3-201ENST00000370536 2132 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 PANO1-201ENST00000620120 1680 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ZNF668-209ENST00000539836 2469 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 AP004608.1-201ENST00000531319 1402 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ACADVL-202ENST00000350303 2191 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 PCED1A-202ENST00000360652 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 RPS6-203ENST00000380384 1355 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 HNRNPLL-204ENST00000409328 1908 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 RASD1-202ENST00000579152 1404 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PSMD3O43242 ZNF664-207ENST00000539644 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.3 ms