Protein–RNA interactions for Protein: O15511

ARPC5, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARPC5O15511 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 C7orf43-206ENST00000456769 2046 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SCOC-207ENST00000506597 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 CDK18-203ENST00000429964 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC090377.1-201ENST00000585691 1762 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC006128.1-201ENST00000624704 1661 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 LGALS9B-201ENST00000324290 1243 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 TMEM204-202ENST00000566264 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 SSUH2-217ENST00000544814 1636 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 POLD2-202ENST00000406581 2158 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
ARPC5O15511 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 UBE2F-201ENST00000272930 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PACSIN3-211ENST00000539589 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CERS1-202ENST00000542296 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 RARG-201ENST00000338561 1836 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 HOXA4-201ENST00000360046 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 GPSM1-201ENST00000291775 2114 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.44■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 IGFBP1-202ENST00000457280 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ASPG-201ENST00000546892 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PARN-205ENST00000539279 1557 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ZNF692-202ENST00000366471 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CAMK2B-207ENST00000358707 1895 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 NAA35-202ENST00000376040 1797 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 INSR-201ENST00000302850 4721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PIANP-201ENST00000320591 2323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 IGFBP1-201ENST00000275525 1653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 SSH3-202ENST00000308298 2046 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
ARPC5O15511 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 219.9 ms