Protein–RNA interactions for Protein: O15056

SYNJ2, Synaptojanin-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,496 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNJ2O15056 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 CD6-203ENST00000352009 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 POM121L13P-201ENST00000422362 380 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 AC004889.1-203ENST00000464929 819 ntTSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 OR2A1-AS1-207ENST00000486094 819 ntBASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 LINC01124-201ENST00000409786 2117 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 CKLF-CMTM1-204ENST00000532838 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 DPF1-209ENST00000456296 1562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 DTD1-201ENST00000377452 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 GJC1-209ENST00000592524 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 AC133561.5-201ENST00000635547 218 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 PML-217ENST00000567543 1404 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 ATRAID-208ENST00000611786 1256 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
SYNJ2O15056 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 HLA-DPB1-211ENST00000418931 1560 ntAPPRIS P2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 EEF1DP3-201ENST00000428783 1309 ntTSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 RARG-204ENST00000543726 1779 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ETHE1-201ENST00000292147 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 LINC02256-201ENST00000561999 366 ntTSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 N4BP2L1-203ENST00000380133 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MCRIP2P1-201ENST00000394346 511 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MRPS26-201ENST00000380325 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MAZ-215ENST00000569978 567 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ACSL1-205ENST00000504900 1583 ntTSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 BASP1-201ENST00000322611 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 AUNIP-203ENST00000538789 1392 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 CYB5R2-212ENST00000533558 1658 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
SYNJ2O15056 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.2 ms