Protein–RNA interactions for Protein: O15054

KDM6B, Lysine-specific demethylase 6B, humanhuman

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Length 1,643 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM6BO15054 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.79■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 RAD21L1-202ENST00000402452 1707 ntTSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 AC106791.1-202ENST00000508281 1148 ntTSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 C16orf74-202ENST00000602583 1237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 CNTD2-202ENST00000430325 1817 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 AGTRAP-203ENST00000376629 1100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 LINC01659-202ENST00000449711 917 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 AL049637.2-201ENST00000641778 930 ntBASIC32.77■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
KDM6BO15054 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 FDX2-202ENST00000393708 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 NME6-213ENST00000451657 871 ntTSL 2 BASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 C20orf196-202ENST00000378979 585 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 HDAC11-203ENST00000402271 1018 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 LSM12P1-201ENST00000411836 588 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 AL807752.2-201ENST00000435463 301 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 NOC4L-201ENST00000330579 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 MEIS3-212ENST00000561293 1918 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 ABCD4-228ENST00000557588 763 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 CERS4-208ENST00000559336 1515 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 TPM1-204ENST00000334895 1637 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 TSPAN11-202ENST00000535215 988 ntTSL 2 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.73■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 MDK-201ENST00000359803 985 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 AC025164.2-201ENST00000501008 1898 ntTSL 5 BASIC32.72■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 SPAG16-209ENST00000447990 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 NPDC1-202ENST00000371601 1494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 SMIM19-201ENST00000414154 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC32.71■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 FGF8-207ENST00000618991 856 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
KDM6BO15054 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 CCDC47-204ENST00000582252 1719 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 FHL3-201ENST00000373016 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC32.69■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
KDM6BO15054 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
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