Protein–RNA interactions for Protein: O14967

CLGN, Calmegin, humanhuman

Predictions only

Length 610 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLGNO14967 SLC41A3-202ENST00000346785 1705 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ARRDC1-AS1-201ENST00000371417 1409 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
CLGNO14967 RBM38-203ENST00000356208 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 TRH-201ENST00000302649 1978 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 MIS18A-201ENST00000290130 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 KRTAP5-1-201ENST00000382171 942 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 IMPA2-201ENST00000269159 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 TRADD-202ENST00000486556 1833 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 ZNF584-205ENST00000596281 575 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 AL359710.1-201ENST00000427039 1544 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
CLGNO14967 KPTN-201ENST00000338134 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
CLGNO14967 BARX2-201ENST00000281437 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 MAIP1-201ENST00000295079 1495 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 HTATIP2-204ENST00000451739 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AC079089.2-201ENST00000531211 1277 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 GOLGA6L9-202ENST00000618348 1710 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
CLGNO14967 BAG4-202ENST00000432471 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 WDR86-207ENST00000621812 1542 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AL357078.1-201ENST00000448344 310 ntTSL 4 BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AL136162.1-201ENST00000607711 1078 ntBASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 DPP7-201ENST00000371579 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 FAM120B-204ENST00000625626 1794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AC010141.3-201ENST00000456659 717 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AC010616.1-201ENST00000597630 2078 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 NOXO1-201ENST00000354249 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
CLGNO14967 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 MIR222HG-202ENST00000602507 1758 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AC009506.1-201ENST00000418474 1494 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AQP6-201ENST00000315520 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLGNO14967 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLGNO14967 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLGNO14967 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
CLGNO14967 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.8 ms