Protein–RNA interactions for Protein: J3KR12

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
J3KR12 HRASLS5-201ENST00000301790 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 CYB5R4-201ENST00000369679 768 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 PARL-206ENST00000435888 1098 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 BEX2-204ENST00000536889 1077 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 SLC7A5P2-201ENST00000553010 536 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 AC092368.3-201ENST00000562549 1107 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 TYMP-202ENST00000395678 1614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
J3KR12 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 MRPL37-201ENST00000336230 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 HTATIP2-208ENST00000532505 595 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 AC106820.5-201ENST00000566085 789 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 TPD52L1-203ENST00000368402 1308 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 HSD11B1L-218ENST00000581773 1687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 CNIH2-201ENST00000311445 1356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 EIPR1-206ENST00000443925 1771 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
J3KR12 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
J3KR12 DCPS-201ENST00000263579 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
J3KR12 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 HLA-C-201ENST00000376228 1536 ntAPPRIS P2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 AP000547.3-201ENST00000592918 1576 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 HCFC1R1-201ENST00000248089 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 YBEY-204ENST00000397692 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 HCFC1R1-207ENST00000574980 845 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 CHRNA10-204ENST00000534359 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
J3KR12 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 C19orf84-201ENST00000570516 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 AC008175.2-201ENST00000612840 297 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 HLA-G-204ENST00000376828 1490 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
J3KR12 KRT7-201ENST00000331817 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 BCKDK-201ENST00000219794 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 SEC61A2-205ENST00000379033 2462 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 UBE2DNL-204ENST00000602536 740 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 TNIP2-203ENST00000503235 1653 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 MOK-226ENST00000522874 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 SH3BP2-204ENST00000452765 2265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
J3KR12 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 EFNA2-201ENST00000215368 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 DOK3-202ENST00000357198 1729 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 MLLT10-204ENST00000377091 905 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 POU5F1P4-201ENST00000413175 1085 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 RARRES2-202ENST00000466675 1618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 SGMS1-210ENST00000619438 1680 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
J3KR12 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 LYPD1-202ENST00000397463 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 DUX4-204ENST00000569241 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 LTK-202ENST00000355166 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 RAP1B-204ENST00000393436 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 GRTP1-202ENST00000375430 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
J3KR12 NAA20-203ENST00000398602 1604 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 PALM-207ENST00000590161 2137 ntTSL 4 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 APOC3-205ENST00000630701 541 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 GPC1-202ENST00000420138 1835 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 MAP1LC3A-201ENST00000360668 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
J3KR12 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
J3KR12 PAXIP1-AS1-201ENST00000608317 2256 ntBASIC21.39■■□□□ 1.02
J3KR12 ERLEC1-203ENST00000405123 1756 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.1 ms