Protein–RNA interactions for Protein: F2Z398

LMO7DN, LMO7 downstream neighbor protein, humanhuman

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMO7DNF2Z398 AC003102.1-201ENST00000588279 569 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SEPT1-201ENST00000321367 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CD247-201ENST00000362089 1609 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CD55-205ENST00000367067 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CENPS-CORT-201ENST00000400900 1469 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 HTT-AS-201ENST00000503893 515 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PFKFB3-216ENST00000625260 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 PLPP7-202ENST00000372264 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SPAST-204ENST00000621856 1715 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 GNB1L-202ENST00000403325 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 OTUB1-211ENST00000543004 1647 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
LMO7DNF2Z398 SAC3D1-205ENST00000531072 1362 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 GGTLC1-201ENST00000278765 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 C2orf50-202ENST00000405022 980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CASP6-205ENST00000505486 538 ntTSL 4 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 AC091874.3-201ENST00000512672 1195 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 FAM21FP-204ENST00000608637 956 ntBASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 HERC2P8-204ENST00000567073 1988 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 HTRA2-201ENST00000258080 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 LIPT2-201ENST00000310109 1018 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CBY3-201ENST00000376974 785 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ELOVL2-AS1-201ENST00000456190 737 ntTSL 3 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 GSEC-202ENST00000629441 1572 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PRR20B-201ENST00000377930 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PRR20A-201ENST00000377931 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PRR20E-201ENST00000434815 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PRR20D-201ENST00000452123 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PRR20C-201ENST00000544357 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PRR20C-202ENST00000614894 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 NARF-205ENST00000412079 1760 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 LINC00471-201ENST00000313064 1282 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ART5-202ENST00000397067 1154 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 HENMT1-203ENST00000402983 1696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PHOSPHO1-206ENST00000514112 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CCDC106-207ENST00000591578 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CCS-208ENST00000533244 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 SMPD2-201ENST00000258052 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 B4GALNT1-203ENST00000449184 1633 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 CERS4-209ENST00000559450 1637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 LINC01578-208ENST00000557147 490 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 AC016588.1-201ENST00000591533 542 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 AC100791.3-201ENST00000617619 330 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 SMUG1-202ENST00000337581 1571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 TGIF1-207ENST00000407501 1585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 PTX4-203ENST00000447419 1516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 DYNC1I1-211ENST00000537881 2146 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
LMO7DNF2Z398 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms