Protein–RNA interactions for Protein: C9JLW8

MCRIP1, Mapk-regulated corepressor-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCRIP1C9JLW8 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SSR2-210ENST00000480567 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 NDOR1-201ENST00000344894 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 TANGO2-202ENST00000398042 2011 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 ACHE-204ENST00000412389 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 UNC119-201ENST00000301032 1653 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 OXCT2-201ENST00000327582 1826 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 TLE3-216ENST00000559191 1575 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 KRTAP5-AS1-201ENST00000424148 2265 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CITED2-202ENST00000536159 1797 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CITED2-203ENST00000537332 1780 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SNAI3-AS1-201ENST00000563261 998 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PIP5K1C-201ENST00000335312 5080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HFE2-202ENST00000357836 2123 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 MFSD7-209ENST00000515118 1556 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 ADAP2-204ENST00000580525 1598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SORCS2-203ENST00000507866 6152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 OXCT2P1-201ENST00000447263 1535 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 OSR2-203ENST00000457907 2126 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 MOGS-201ENST00000233616 2895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SIMC1-203ENST00000429602 2694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 EMC9-201ENST00000216799 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 GJB6-203ENST00000400065 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 FAM3A-208ENST00000419205 1763 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PIAS2-203ENST00000545673 1590 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HSPB2-201ENST00000304298 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 MSANTD1-204ENST00000510580 2039 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 TTYH1-203ENST00000376531 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PRR16-202ENST00000407149 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 COLEC12-201ENST00000400256 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 RNF166-202ENST00000537718 1525 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PRSS33-202ENST00000570702 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 AL034346.1-201ENST00000568244 1277 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
MCRIP1C9JLW8 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 IRX4-207ENST00000613726 2403 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 FEM1AP1-201ENST00000431297 1995 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 NARF-202ENST00000345415 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
MCRIP1C9JLW8 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms